MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011981	GCC	2	6	621572	621577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102933
10502	NC_011981	GCA	2	6	621595	621600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102933
10503	NC_011981	TAT	2	6	621659	621664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102933
10504	NC_011981	CAT	2	6	621691	621696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102933
10505	NC_011981	CCG	2	6	621712	621717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102933
10506	NC_011981	TGC	2	6	622022	622027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102934
10507	NC_011981	CGG	2	6	622045	622050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102934
10508	NC_011981	GCC	3	9	622053	622061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102934
10509	NC_011981	TGC	2	6	622124	622129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102934
10510	NC_011981	TGG	2	6	622150	622155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102934
10511	NC_011981	TGC	3	9	622250	622258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102934
10512	NC_011981	GCC	2	6	622276	622281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102934
10513	NC_011981	GCT	2	6	622371	622376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102934
10514	NC_011981	TTG	2	6	622387	622392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102934
10515	NC_011981	GC	3	6	622408	622413	0 %	0 %	50 %	50 %	222102934
10516	NC_011981	CGT	2	6	622461	622466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102934
10517	NC_011981	CCG	2	6	622511	622516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102934
10518	NC_011981	AAG	2	6	622591	622596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102934
10519	NC_011981	CG	3	6	622672	622677	0 %	0 %	50 %	50 %	222102935
10520	NC_011981	GCTGAC	2	12	622715	622726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222102935
10521	NC_011981	TTG	2	6	622794	622799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102935
10522	NC_011981	ACG	2	6	622875	622880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102935
10523	NC_011981	GCC	2	6	622924	622929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102935
10524	NC_011981	CGC	2	6	622930	622935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102935
10525	NC_011981	GCA	2	6	622964	622969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102935
10526	NC_011981	GCG	2	6	623044	623049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
10527	NC_011981	GGC	2	6	623102	623107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
10528	NC_011981	GCG	2	6	623116	623121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
10529	NC_011981	GC	3	6	623174	623179	0 %	0 %	50 %	50 %	222102935
10530	NC_011981	GAT	2	6	623192	623197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102935
10531	NC_011981	CATC	2	8	623275	623282	25 %	25 %	0 %	50 %	222102935
10532	NC_011981	GCC	2	6	623310	623315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102935
10533	NC_011981	GCG	2	6	623362	623367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
10534	NC_011981	TGC	3	9	623380	623388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102935
10535	NC_011981	GCA	2	6	623396	623401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102935
10536	NC_011981	TTG	2	6	623535	623540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102935
10537	NC_011981	AGG	2	6	623586	623591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102935
10538	NC_011981	GATGCA	2	12	623639	623650	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222102935
10539	NC_011981	GCA	2	6	623695	623700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102935
10540	NC_011981	AAG	2	6	623805	623810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102935
10541	NC_011981	TTG	2	6	623850	623855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102935
10542	NC_011981	TGCC	2	8	623976	623983	0 %	25 %	25 %	50 %	222102935
10543	NC_011981	GGC	2	6	623998	624003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
10544	NC_011981	GCTG	2	8	624055	624062	0 %	25 %	50 %	25 %	222102935
10545	NC_011981	TGGC	2	8	624064	624071	0 %	25 %	50 %	25 %	222102935
10546	NC_011981	CCGG	2	8	624078	624085	0 %	0 %	50 %	50 %	222102935
10547	NC_011981	CGG	2	6	624092	624097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
10548	NC_011981	TGC	2	6	624107	624112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102935
10549	NC_011981	CCG	2	6	624135	624140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102935
10550	NC_011981	GCCA	2	8	624212	624219	25 %	0 %	25 %	50 %	222102935
10551	NC_011981	GCG	2	6	624259	624264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
10552	NC_011981	ACG	2	6	624267	624272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102935
10553	NC_011981	CGA	2	6	624273	624278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102935
10554	NC_011981	TGG	2	6	624330	624335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102935
10555	NC_011981	GCG	2	6	624381	624386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102935
10556	NC_011981	GC	4	8	624391	624398	0 %	0 %	50 %	50 %	222102935
10557	NC_011981	ATC	2	6	624413	624418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102935
10558	NC_011981	GCT	2	6	624421	624426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102935
10559	NC_011981	AC	3	6	624493	624498	50 %	0 %	0 %	50 %	222102935
10560	NC_011981	GGT	2	6	624556	624561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102935
10561	NC_011981	CGC	2	6	624592	624597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102935
10562	NC_011981	GCG	2	6	624625	624630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102936
10563	NC_011981	ACA	2	6	624631	624636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102936
10564	NC_011981	GCC	2	6	624891	624896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102936
10565	NC_011981	TGCCTC	2	12	624929	624940	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222102936
10566	NC_011981	GAC	2	6	624978	624983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102936
10567	NC_011981	GGC	2	6	625013	625018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102936
10568	NC_011981	CG	4	8	625103	625110	0 %	0 %	50 %	50 %	222102936
10569	NC_011981	CTG	3	9	625119	625127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102936
10570	NC_011981	GGC	2	6	625211	625216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102936
10571	NC_011981	GT	3	6	625309	625314	0 %	50 %	50 %	0 %	222102936
10572	NC_011981	CGG	2	6	625337	625342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102936
10573	NC_011981	CTG	2	6	625398	625403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102936
10574	NC_011981	CCG	2	6	626164	626169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102937
10575	NC_011981	GCT	2	6	626192	626197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102937
10576	NC_011981	CGG	2	6	626371	626376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102937
10577	NC_011981	ATGG	2	8	626384	626391	25 %	25 %	50 %	0 %	222102937
10578	NC_011981	CAC	2	6	626438	626443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102937
10579	NC_011981	GTG	2	6	626490	626495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102937
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10581	NC_011981	GACG	2	8	626573	626580	25 %	0 %	50 %	25 %	222102937
10582	NC_011981	CGC	2	6	626654	626659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102937
10583	NC_011981	GCGT	2	8	626824	626831	0 %	25 %	50 %	25 %	222102937
10584	NC_011981	CTG	2	6	626849	626854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102937
10585	NC_011981	GGTG	2	8	626917	626924	0 %	25 %	75 %	0 %	222102937
10586	NC_011981	CGC	2	6	627099	627104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102938
10587	NC_011981	CGGCGT	2	12	627122	627133	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222102938
10588	NC_011981	GAC	2	6	627134	627139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102938
10589	NC_011981	GCC	2	6	627190	627195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102938
10590	NC_011981	TGC	2	6	627209	627214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102938
10591	NC_011981	CGT	2	6	627224	627229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102938
10592	NC_011981	TGC	2	6	627260	627265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102938
10593	NC_011981	GAA	2	6	627377	627382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102938
10594	NC_011981	GAC	2	6	627395	627400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102938
10595	NC_011981	CAAC	2	8	627445	627452	50 %	0 %	0 %	50 %	222102938
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10599	NC_011981	CTG	2	6	627774	627779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102938
10600	NC_011981	GC	3	6	627807	627812	0 %	0 %	50 %	50 %	222102938
10601	NC_011981	CGT	2	6	627845	627850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102938
10602	NC_011981	CAC	2	6	627860	627865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102938
10603	NC_011981	GGC	2	6	627885	627890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102938
10604	NC_011981	CCGG	2	8	627910	627917	0 %	0 %	50 %	50 %	222102938
10605	NC_011981	CAT	2	6	627923	627928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102938
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10607	NC_011981	CGG	2	6	627953	627958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102938
10608	NC_011981	GGC	2	6	627966	627971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102938
10609	NC_011981	CAA	2	6	628187	628192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102938
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10611	NC_011981	GT	3	6	628240	628245	0 %	50 %	50 %	0 %	222102938
10612	NC_011981	CGA	2	6	628283	628288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102938
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10614	NC_011981	GTCC	2	8	628652	628659	0 %	25 %	25 %	50 %	222102939
10615	NC_011981	AACGC	2	10	628692	628701	40 %	0 %	20 %	40 %	222102939
10616	NC_011981	GGT	2	6	629161	629166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102940
10617	NC_011981	CCG	2	6	629172	629177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102940
10618	NC_011981	GAT	2	6	629194	629199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102940
10619	NC_011981	TTC	2	6	629204	629209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102940
10620	NC_011981	TGA	2	6	629277	629282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102940
10621	NC_011981	GCG	2	6	629335	629340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102940
10622	NC_011981	ATG	2	6	629352	629357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102940
10623	NC_011981	ATC	2	6	629531	629536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102940
10624	NC_011981	AC	3	6	629658	629663	50 %	0 %	0 %	50 %	222102940
10625	NC_011981	GTCG	2	8	629696	629703	0 %	25 %	50 %	25 %	222102940
10626	NC_011981	GTC	2	6	629728	629733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102940
10627	NC_011981	TGC	2	6	629994	629999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102940
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10629	NC_011981	GCTC	2	8	630043	630050	0 %	25 %	25 %	50 %	222102940
10630	NC_011981	ATC	2	6	630053	630058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102940
10631	NC_011981	GAT	2	6	630064	630069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102940
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10633	NC_011981	AG	3	6	630089	630094	50 %	0 %	50 %	0 %	222102940
10634	NC_011981	TGA	2	6	630232	630237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102941
10635	NC_011981	ATA	2	6	630274	630279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102941
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10641	NC_011981	TGG	2	6	630498	630503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102941
10642	NC_011981	ACG	2	6	630545	630550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102941
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10644	NC_011981	GA	3	6	630588	630593	50 %	0 %	50 %	0 %	222102941
10645	NC_011981	CGT	2	6	630678	630683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102941
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10648	NC_011981	TTG	2	6	630746	630751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102941
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10650	NC_011981	ACG	2	6	630838	630843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102941
10651	NC_011981	CTTCAG	2	12	630883	630894	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222102941
10652	NC_011981	CGC	2	6	630906	630911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102941
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10655	NC_011981	AG	3	6	631074	631079	50 %	0 %	50 %	0 %	222102941
10656	NC_011981	CGA	2	6	631085	631090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102941
10657	NC_011981	T	7	7	631164	631170	0 %	100 %	0 %	0 %	222102941
10658	NC_011981	CAT	2	6	631236	631241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102941

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